På initiativ av Sam Larsson inrättades FPES Forskningsfond 1993 genom beslut i FPES styrelse för att aktivt stödja forskningen kring transvestism (som föreningen då var inriktad mot) och hålla kontakt med ny kunskap inom området. I Sverige hade viss forskning och en studie gjorts av Maj-Briht Bergström-Walan 1971 och en något större enkätundersökning av Anette Hall 1982. 1990 påbörjade Sam Larsson sin doktorsavhandling Det andra jaget vid manlig transvestism med djupintervjuer av några av FPES medlemmar; arbetet avslutades med disputation 1997.

Tidig inriktning mot transvestism

Under 1990-talet arrangerade Forskningsfondens arbetsutskott bland annat två mycket välbesökta seminarier på Läkaresällskapet i Stockholm, varav ett med Virginia Prince (grundare av FPE i USA) som huvudtalare. Hon var en av de ledande forskarna i världen om transvestism.

Arbetsutskottet deltog också i av andra anordnade seminarier och gav på eget förlag ut boken Transvestism och det andra jaget (1994) av Sam Larsson och Maj-Briht Bergström-Walan i samarbete med Anette Hall, samt publicerade den enkätbaserade studien Hustrur till transvestiter – deras attityder till manlig transvestism (1995) i facktidskriften Nordisk Sexologi. Sam Larsson och Maj-Briht Bergström-Walan publicerade även en artikel: Multi-sexuality, cross-dressing and the multiplicity of mind (1999) i Scandinavian Journal of Sexology.

Vidgning till hela transområdet

En vidgning till hela transområdet framkallade ett behov av förtydligande, varför FPES Forskningsfond i november 2000 namnändrades till AFTO (Akademin för Forskning inom TransgenderOmrådet) och en instruktion för AFTO stadfästes av FPES årsmöte i mars 2002. Perspektivet vidgades till att omfatta hela transområdet även om visst fokus på transvestism kvarstod.

Hösten 2008 överlämnade AFTO en mycket omfattande rapport – Vem får man vara i vårt samhälle? – till Folkhälsoinstitutet. Detta var då en av de mest omfattande kunskapsöversikterna om transfrågor som gjorts i Sverige och ska ses som ett historiskt dokument om hur samhället genom åren har sett på transpersoner. Rapporten utarbetades av Sam Larsson, John Lilja och Bjöörn Fossum i samarbete med Maj-Briht Bergström-Walan och Marianne Berg. Läs mer: Vem får man vara i vårt samhälle? Om transpersoners psykosociala situation och psykiska hälsa eller Vem får man vara i vårt samhälle? En kort introduktion.

Utökad forskningsinriktning

FPES årsmöte 2014 beslöt att AFTO skall uttydas som Arbetsgruppen för Forskning inom TransOmrådet. I den sedan dess gällande instruktionen för AFTO framhålls att verksamheten inte är begränsad till något visst perspektiv eller någon viss forskningsinriktning. Arbetsgruppen är fri att efter egna överväganden fokusera på frågeställningar, undersökningar och så vidare som den finner angelägna.